通過對細胞攝入的顆粒或蛋白質結合物進行酸化，可以監測細胞攝取和內化的多種過程。顆粒和蛋白經過內化作用進入囊泡，這些囊泡相對于細胞外環境是酸性的。利用對pH敏感的熒光探針，可檢測通路進程，并追蹤從早期內體(pH  6.3)至溶酶體(pH  4.7)或再循環的整個過程。


吞噬作用

在吞噬作用中，細胞內化顆粒物質，如微生物，這一過程對于免疫反應和凋亡細胞清除過程非常重要。

內吞作用和胞飲作用

內吞作用是細胞內吞非蛋白質或多糖等非顆粒物質的過程。該過程對于代謝和細胞信號非常重要。熒光蛋白和有機染料是對囊泡壁和囊泡內容物進行染色的最有用的指示劑。由于囊泡pH會在內吞過程中發生改變，因此，也可利用pH指示劑檢測通路的整個進程。


配體內化

配體內化是一種受體介導的內吞過程，其中如果細胞與其細胞表面上的特定受體蛋白結合，則細胞只吸收細胞外分子。配體內化是一種重要的細胞信號事件，我們可提供多種以常見受體為靶標的熒光配體。